六合区位于南京市北部，东与仪征市交界，南接浦口区，隔长江与南京市主城区相望，西与安徽省来安县相邻，北与安徽省天长市接壤。区人民政府驻雄州街道雄州南路268号，邮政编码211500。

区内地势北高南低，北部为丘陵岗地，平均海拔20米。境内有山丘60多座，中小型水库、湖泊56处，大小河流60多条，形成山中有水、水中有山的秀丽景色。南部和中部为平原，沿东北部冶山至中部骡子山向西北至大圣、竹镇芝麻岭一线为江淮分水岭，南侧为长江水系，北侧是淮河水系。矿产资源有30多种。六合是“天赐国宝、中华一绝”雨花石的主产地，江苏民歌《茉莉花》的发源地。

六合生态环境优良，是国家生态区，拥有1个国家地质公园和6个省市级森林公园，竹镇止马岭——大泉湖风景区是江苏省空气质量标准对照区。金牛湖为南京最大的人工湖，是2014年南京青奥会帆船赛事举办地。

六合是沟通苏北、皖北的重要枢纽，交通便捷，素有“江北交通城”之誉。流经苏皖两省的滁河横穿境中入长江，拥有46千米长江“黄金水道”（含大厂），属长江下游“金三角”经济区。六合是“天赐国宝，中华一绝”雨花石主产地、江苏民歌《茉莉花》采风源头。金牛湖为南京最大人工湖，是南京青奥会帆船赛事及中华龙舟大赛（南京站）举办地。宁通、宁淮、宁洛等多条高等级公路在境内交会，宁启铁路复线、正在建设中的宁淮高铁和北沿江高铁穿境而过，宁天城际（S8线）地铁、栖霞山大桥、正在建设中的仙新路过江通道、规划中的地铁14号线以及江北大道快速路与南京主城无缝对接；六合机场建成启用；常年通航的滁河为规划5级航道。沿长江北岸有－12.5米江海联运西坝港；境内还有鲁宁、仪长、西气东输、川气东送等油气长输管道，“水陆空铁管”五种运输模式俱全。区内建有1400余千米镇村沥青或水泥路面。

2002年4月，经国务院批准，六合县与大厂区合并成立南京市六合区，全区辖7个街道、12个镇。2017年，大厂等3个街道由江北新区统一托管。六合区辖雄州、龙池、金牛湖、程桥、横梁、龙袍、马鞍、冶山8个街道和竹镇镇1个镇，58个居民委员会、47个村民委员会。据公安年报统计，2024年末全区户籍总人口680047人。