土地资源　根据2023年度土地变更调查成果，六合行政区土地总面积1470.99平方千米。不含江北新区原六合板块大厂、长芦、葛塘3个街道，辖区内土地总面积1295.27平方千米，其中耕地532.08平方千米、园地17.38平方千米、林地216.19平方千米、草地23.22平方千米、湿地6.84平方千米、城镇村及工矿用地193.83平方千米、交通运输用地57.34平方千米、水域及水利设施用地245.12平方千米、其他土地3.26平方千米。

矿产资源　六合区是南京市矿产资源蕴藏丰富地区之一，矿产资源种类较多。探明矿种有铁、铜、蓝宝石、花岗岩、玄武岩、辉绿岩、白云岩、凹凸棒石黏土、黄砂、红砂、矿泉水等30多种，其中铁、建筑用石材、建筑用砂、凹凸棒石黏土、铸型用砂，雨花（玛瑙）石、矿泉水等有一定开采规模，开采历史较久。据统计，储量铁矿石300万吨。玄武岩D级储量8500万吨，黄砂D级储量7200万吨（其中雨花石1.5万吨），大理石、白云石、石灰石D级储量1.5亿吨，花岗岩储量1亿立方米，铸石用玄武岩储量800万吨，石英砂储量1亿吨，矿泉水年自然流量500万立方米，凹凸棒石黏土储量1亿吨。龙袍街道东沟奶山地热矿井为区第一口地热温泉，在江苏省地热井中深度位列第一。

水资源　2023年，全区降水量956.8毫米，折合降水总量124千万立方米。水资源总量39.5千万立方米，其中地表水资源量37.1千万立方米、地下水资源量11.4千万立方米，重复计算量9千万立方米。