流经苏皖两省的滁河横穿境中入江，拥有46公里长江“黄金水道”，属长江下游“金三角”经济区。六合是“天赐国宝，中华一绝”的雨花石主产地、江苏民歌《茉莉花》的采风源头。区内地势北高南低，北部为丘陵岗地，平均海拔20米。境内有山丘60多座，中小型水库、湖泊56座，大小河流60多条，形成山中有水、水中有山的秀丽景色。南部和中部为平原，沿东北部冶山至中部骡子山向西北至大圣、竹镇芝麻岭一线为江淮分水岭，南侧为长江水系，北侧是淮河水系。全区有耕地5.93万公顷，水域面积2.55万公顷。属北亚热带季风温湿气候区，气候温和，雨量充沛，光照充足，四季分明，常年平均气温15.6℃。